Amoebozoa (classification phylogénétique)

Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Amoebozoa (Amœbozoaires, Amibes), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations de parenté existant entre leurs différents groupes (ou taxa), telles que les dernières analyses reconnues les proposent. Ce n'est qu'une possibilité, et les principaux débats qui subsistent au sein de la communauté scientifique sont brièvement présentés ci-dessous, avant la bibliographie.

Arbre phylogénétique

Le cladogramme présenté ici ne possède qu'une valeur indicative. Il n'est pas forcément consensuel, et on peut toujours se référer à la bibliographie au bas de l'article.

Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré. Tout nœud de l'arbre portant plus de deux branches montre une indétermination de la phylogénie interne du groupe considéré.

Les habitudes typographiques des botanistes et des zoologistes sont différentes. Ici, par commodité de lecture, et certains groupes actuels relevant des deux domaines traditionnels, les noms de taxons supérieurs au genre sont tous écrits en caractères droits, les noms de genres ou d'espèces en italiques.

À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien ; (Edi) : Édiacarien. Pour plus de précision si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.

▲
└─o Amoebozoa
  ├─o Tubulinea
  │ ├─o Leptomyxida
  │ └─o
  │   ├─o Tubulinida
  │   └─o Testacealobosea
  │     └─o Arcellinida
  └─o
    ├─o Flabellinea
    │ ├─o Himatismenida
    │ └─o
    │   ├─o Dactylopodida ou Conopodina
    │   └─o Vannellida
    └─o
      ├─o
      │ ├─o Acanthamoebida ou Acanthopodina
      │ ├─o Thecamoebida
      │ └─? Stereomyxidae
      └─o Conosea
        ├─o Phalansterea
        └─o
          ├─o Filamoebidae
          └─o Conosa
            ├─o Archamoebae
            └─o Mycetozoa

Arbre développé

▲
└─o Amoebozoa
  ├─o Tubulinea
  │ ├─o Echinamoeba
  │ └─o
  │   ├─o Leptomyxida
  │   │ ├─o Flabellulidae
  │   │ └─o Leptomyxidae
  │   └─o
  │     ├─o Tubulinida
  │     │ └─o Hartmannellidae et Amoebidae
  │     └─o Testacealobosea
  │       ├─? Trichosidae
  │       └─o Arcellinida
  │         ├─o Phryganellina
  │         │ ├─o Phryganellidae
  │         │ └─o Cryptodifflugiidae
  │         ├─? Difflugiidae
  │         ├─? Lamtopyxidae
  │         ├─? Distomatopyxidae
  │         ├─? Plagiopyxidae
  │         ├─? Paraquadrulidae
  │         ├─? Lesquereusidae
  │         ├─o Heleoperidae
  │         └─o
  │           ├─o Hyalospheniidae ou Nebelidae
  │           └─o
  │             ├─o Trigonopyxidae
  │             └─o
  │               ├─o Centropyxidae
  │               └─? Arcellina
  │                 ├─o Arcellidae
  │                 ├─o Microcoryciidae
  │                 └─o Microchlamyiidae
  └─o
    ├─o Flabellinea
    │ ├─o Himatismenida ou Cochliopodiidae
    │ └─o 
    │   ├─o Mayorella
    │   └─o
    │     ├─o Dermamoeba
    │     └─o
    │       ├─o Dactylopodida ou Conopodina
    │       └─o Vannellida
    └─o
      ├─o
      │ ├─o Centramoebida
      │ │ ├─o Acanthamoebidae ou Acanthopodina
      │ │ └─o Balamuthiidae
      │ ├─o Thecamoebida
      │ └─? Stereomyxida
      │   ├─o Stereomyxidae
      │   └─o Corallomyxidae
      └─o Conosea
        ├─o Phalansterea
        └─o
          ├─o
          │ ├─o Multicilia
          │ └─o Gephyramoeba
          └─o
            ├─o Filamoebidae
            └─o Conosa
              ├─o Archamoebae
              │ ├─o Pelobiontida
              │ │ ├─o Pelomyxidae
              │ │ └─o Entamoebidae
              │ └─o Mastigamoebida
              │   ├─o Endolimax
              │   └─o Mastigamoebidae
              └─o Mycetozoa
                ├─o Guttulinia
                ├─o Hyperamoebae
                └─o Eumycetozoa
                  ├─o Dictyosteliida
                  │ ├─o Acytosteliidae
                  │ └─o Dictyosteliidae
                  └─o Eumyxa
                    ├─o Protostelia
                    │ ├─o Echinosteliopsida
                    │ └─o Protosteliida
                    │   ├─o Cavosteliidae
                    │   ├─o Ceratiomyxidae
                    │   └─o Protosteliidae
                    └─o Myxogastria
                      ├─o Liceida
                      │ ├─o Liceidae
                      │ ├─o Listerellidae
                      │ └─o Enteridiidae
                      ├─o Trichiida
                      │ ├─o Dianemidae
                      │ └─o Trichiidae
                      ├─o Stemonitida
                      └─o Myxogastromycetidae
                        ├─o Echinosteliida
                        │ ├─o Echinosteliidae
                        │ └─o Clastodermidae
                        └─o Physariida
                          ├─o Elaeomyxidae
                          ├─o Physaridae
                          └─o Didymiidae

Lycogala epidendrum (Mycetozoa, Reticulariaceae)
Thecamoeba striata (Amoebozoa)
Reticularia lycoperdon (Mycetozoa, Reticulariaceae)

Débat scientifique relatif à la phylogénie des Amoebozoa

Classification proposée par Adl et al. 2005

Ce comité a proposé une nouvelle classification, remplaçant celle des anciens Protistes et tenant compte des phylogénies moléculaires récentes. Elle regroupe les Eucaryotes en six groupes réputés monophylétiques. Voici ce qui concerne les Amoebozoa.

Classification proposée par Adl et al. 2005

▲
└─o Amoebozoa
  ├─o Tubulinea
  │ ├─o Tubulinida
  │ ├─o Leptomyxida
  │ ├─o Testacealobosia
  │ │ ├─o Arcellinida
  │ │ └─? Trichosphaerium
  │ └─? Echinamoeba
  ├─o Flabellinea (paraphylétique)
  │ ├─o Dactylopodida
  │ ├─o Vannellida
  │ ├─o Thecamoebida (paraphylétique)
  │ ├─o Cochliopodium
  │ └─? divers genres
  ├─o Stereomyxida (peut-être paraphylétique)
  ├─o Acanthamoebidae
  ├─o Entamoebida
  ├─o Mastigamoebidae
  ├─o Pelomyxa
  ├─o Eumycetozoa
  │ ├─o Protostelia (paraphylétique)
  │ ├─o Myxogastria
  │ ├─o Dictyostelia
  │ └─? divers genres
  ├─? divers genres
  └─o Spongomonadida
    ├─o Phalansterium
    └─o Spongomonadidae

En savoir plus

: document utilisé comme source pour la rédaction de cet article.

Sources bibliographiques de référence

Alexey Smirnov, Elena Nassonova, Cédric Berney, José Fahrni, Ignacio Bolivar et Jan Pawlowski : « Molecular Phylogeny and Classification of the Lobose Amoebae », Protist, vol. 156, n°2, pp. 129-142, 2005
Sina M. Adl et alii : « The New Higher Level Classification of Eukaryotes », J. Eukaryot. Microbiol., vol. 52, n°5, pp. 399–451, 2005

Autres sources bibliographiques

Thomas Cavalier-Smith (2003) « Protist phylogeny and the high-level classification of Protozoa », Europ. J. Protistol., 39, pp. 338-348

Sources internet

« Molecular phylogeny of amoeboid protists »^{(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?)}
Mikko's Phylogeny Archive
The Taxonomicon
« Palaeos.org »^{(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?)}
« Micro*scope »^{(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?)}
NCBI Taxonomy Browser
The Tree of Life Web Project

Liens internes